Il corso ha lo scopo di fornire le basi per la comprensione delle principali metodiche sperimentali utilizzate per lo studio dei geni e dei relativi prodotti genici, sia in vitro che in cellule e organismi, e di offrire le conoscenze necessarie alla comprensione dei principali algoritmi e programmi utilizzati per l’analisi computazionale di sequenze e altri dati biologici.
Le lezioni del corso sono state realizzate dal Prof. Giovanni Paolella e dalla Dott. Leandra Sepe. Le lezioni n. 8, 9, 11, 14, 15, 17 e 20 sono state realizzate in collaborazione con la Prof. M. Bevilacqua.
Gli studenti devono accedere alle lezioni messe a disposizione sul sito, seguirle e svolgere i test finali previsti per ogni Lezione. E’ inoltre necessario eseguire le esercitazioni previste, e, dove indicato, inviare i risultati mediante "upload" al sito. Per l’accesso ad alcune funzionalità è necessario registrarsi per l’esecuzione di programmi in maniera remota.
1. Genomi: organizzazione e complessità
4. Assemblaggio e annotazione di genomi (ENSEMBL)
5. Package e interfacce per la gestione di sequenze
7. Allineamento di sequenze mediante matrici di punti
10. Algoritmi dinamici di allineamento
11. Elettroforesi
13. Algoritmi di allineamento di tipo euristico
14. Preparazione di acidi nucleici
15. Cromatografia
18. Banche dati
20. Vitalità e proliferazione di cellule in coltura
21. Microscopia
ATTIVITA DIDATTICA
A partire dal 1995, l’attivita didattica è stata svolta
nell ambito delle Facolta di Agraria e di Scienze
Matematiche, Fisiche e Naturali dell Universita del
Molise, tenendo i seguenti corsi nel settore
scientifico-disciplinare BIO/10:
1996-2000 Biochimica; 1996-1997 Enzimologia;
1997-2000 Biochimica applicata; 2001-2006
Biochimica Cellulare, Biomolecole e
Metabolismo, Biochimica Strutturale; 2003-2006 Bioinformatica. Inoltre sono stati tenuti i seguenti corsi nel settore BIO/11: 1997-2004 Biologia Molecolare.
Infine è stata svolta attivita didattica mediante
supplenza presso l’Universita di Napoli Federico II,
Facolta di Scienze Biotecnologiche per i seguenti
corsi: 2001-2002 Metodologia Diagnostica Molecolare
2002-2006; Biotecnologie Molecolari con laboratorio (bioinformatica); 2004-2006 Bioinformatica