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Vincenzo De Simone » Argomenti ed organizzazione del corso di Biologia Molecolare in formato e-learning

Argomenti ed organizzazione del corso di Biologia Molecolare in formato e-learning

Dott.ssa De Magistris

Prof. De Simone

Presentazioni con commento audio e filmati

Lezione A (2 h): Aspetti generali
- L’argomento sarà trattato privilegiando i meccanismi di base ed i processi comuni a tutte le cellule
Lezione B (2h): Approfondimenti
- Saranno approfonditi gli aspetti regolativi e le differenze tra diversi sistemi biologici
Lezione C (90′): Aspetti Applicativi
- Saranno evidenziate le più comuni applicazioni pratiche di laboratorio delle nozioni acquisite in A e B

Un incontro settimanale con docente + tutor

Parte I (60′): Problem Based Learning
- A partire da uno o più problematiche di tipo applicativo, saranno discussi e commentati gli argomenti trattati nelle lezioni A, B e C relative al tema della settimana
Parte II (60′): Verifica di Apprendimento
- Gli studenti risponderanno a quesiti relativi al tema della settimana. I risultati concorreranno alla composizione del voto finale nella misura del 5% per ciascuna prova (40% tot.)
Esame conclusivo:
- Gli studenti risponderanno a quesiti relativi a tutto il programma svolto. I risultati concorreranno alla composizione del voto finale nella misura del 60%. Saranno ammessi gli studenti che hanno partecipato ad almeno 6 delle lezioni in presenza ed effettuato (o recuperato) tutte le verifiche settimanali di apprendimento

I-A) Struttura e conformazioni degli acidi nucleici
I-B) Organizzazione della cromatina eucariotica
I-C) Metodiche di estrazione e di analisi degli acidi nucleici:
- (spettrofotometria, elettroforesi, Southern blotting)

Struttura degli Acidi Nucleici

II-A) Componenti e funzionamento della forca di replicazione
II-B) Controllo dell’inizio e della terminazione della replicazione
II-C) Utilizzo in laboratorio degli enzimi della replicazione:
- (marcatura del DNA, sequenziamento, PCR)

La Replicazione del DNA

III-A) Basi molecolari della ricombinazione del DNA
III-B) Mutazioni e meccanismi molecolari di riparo del DNA
III-C) Metodiche di ricombinazione in vitro (ingegneria genetica):
- (enzimi di restrizione, ricombinazione molecolare, clonaggio in plasmidi, trasformazione batterica)

Ricombinazione e Riparo del DNA

IV-A) Struttura e funzionamento della RNA polimerasi batterica
IV-B) Regolazione della trascrizione in procarioti
IV-C) Metodiche di studio delle interazioni DNA-proteine:
- Electrophoretic Mobility Shift Assay (EMSA), DNA footprinting

La Trascrizione nei Procarioti

V-A) Le 3 RNA polimerasi eucariotiche ed i relativi promotori
V-B) Regolazione della trascrizione negli eucarioti
V-C) Studio dei promotori e dei fattori trascrizionali eucariotici:
- (vettori di espressione eucariotici, trasfezioni ed espressione transiente in cellule eucariotiche, animali transgenici)

La Trascrizione negli Eucarioti

VI-A) Maturazione degli RNA eucariotici
VI-B) Splicing autocatalitico, ribozimi ed RNA interference
VI-C) Applicazioni pratiche dei ribozimi e dell’RNA interference:
- (progettazione e costruzione di vettori per il “silenziamento” di geni)

RNA catalitici e Maturazione dell'mRNA

VII-A) Le tappe della sintesi delle proteine in pro- ed eucarioti
VII-B) Regolazione della sintesi delle proteine
VII-C) Sintesi di proteine in vitro e genoteche di espressione:
- (trascrizione e traduzione in vitro, genoteche di espressione ed a display fagico)

La Sintesi delle Proteine

VIII-A) Segnalatori, recettori e trasduzione del segnale
VIII-B) Regolazione del ciclo cellulare e dell’apoptosi
VIII-C) Metodiche di studio delle interazioni proteina-proteina:
- (Western blotting, immunoprecipitazione, doppio ibrido)