Vincenzo De Simone » 14.Regolazione della trascrizione negli eucarioti

V-B) Regolazione della trascrizione negli eucarioti

Prof. Vincenzo De Simone

Dott.ssa Luisa De Magistris

Gli argomenti trattati in questa lezione:

Attivazione trascrizionale per interazione diretta

Attivazione trascrizionale tramite complessi “mediatori”

Il dominio “elica-giro-elica” (HTH)

Esempi di domini HTH

Domini HTH ed omeodomini

“Omeodomini” e DNA

Il dominio a “dita di zinco” ( ZF )

Legame al DNA di un dominio a tre ZF

Confronto di domini ZF di tipo C2H2 e C4

Fattori trascrizionali dimerici

Domini a “cerniera di leucina”

Fattori bZIP e dimerizzazione

Eterodimeri ed attivazione

Eterodimeri ed inibizione

Il dominio “elica-ansa-elica” ( bHLH)

Fattori bHLH e dimerizzazione

Il dominio nastro-elica-elica

Il complesso d’inizio di Pol-II

Quattro meccanismi di repressione

Metilazione e silenziamento

Modello combinatorio della regolazione trascrizionale

Approf.1: circuiti di regolazione negli epatociti

Approf. 2: Evoluzione dei circuiti regolatori

Approf. 3: Co-evoluzione di fattori trascrizionali e microRNA

Due tappe nella regolazione dell’inizio della trascrizione

Attivazione per rimodellamento della cromatina

Attivazione per acetilazione degli istoni

Enhancers ed “isolatori”

Organizzazione di un dominio cromatinico

LCR dei geni per la beta-globina

Tre domini cromatinici

Approf. 4: Rimodellamento della cromatina nel locus delle β-globine

Tre modelli d’interazione a distanza

Colinearità tra POSIZIONE dei geni sul cromosoma ed ESPRESSIONE lungo l’asse antero-posteriore dell’embrione

Approf. 5: Anse e gradienti trascrizionali