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Vincenzo De Simone » 10.Struttura e funzionamento dell'RNA polimerasi batterica


IV-A) Struttura e funzionamento dell’RNA polimerasi batterica

Prof. Vincenzo De Simone

Dott.ssa Luisa De Magistris

IV – La Trascrizione nei Procarioti


Filamento codificante e filamento stampo


Definizione di unità trascrizionale


Subunità della RNA polimerasi di E.coli


Modello a “chela di granchio” dell’RNA polimerasi


Promotori procariotici


Le sequenze “consenso” a -35 e -10


Interazioni tra il promotore e -70


La regione N-terminale del fattore sigma


Interazioni tra il promotore e l’oloenzima


Punti di contatto dell’RNA polimerasi


L’elica 2.4 di sigma lega la sequenza -10


Come sigma si dispone nella “chela”


Le tappe della trascrizione


Tappe dell’inizio della trascrizione


Formazione del complesso chiuso


Cinetica di formazione del complesso d’inizio


Associazione e dissociazione di sigma e del nucleo enzimatico


Trascrizione e superavvolgimenti del DNA


Bolla di trascrizione e struttura dell’RNA polimerasi


Meccanismi di “Proofreading” dell’RNA polimerasi


Riattivazione dell’RNA polimerasi in stallo


Il terminatore intrinseco


Legame di rho sul sito rut


Terminazione rho-dipendente


I materiali di supporto della lezione

Alberts B & al. Biol. Mol. della Cellula (essenziale), Zanichelli, Cap. 7

Brown TA, Genomi II, EdiSES, Cap. 9

Brown TA, Biotecnologie Molecolari, EdiSES

Lewin B, Il Gene VIII, Zanichelli, Cap. 9

Lewin B, Il Gene (ed.compatta), Zanichelli, Cap. 11

Watson JD & al., Biologia Molecolare del Gene, Zanichelli, Cap. 12

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