I – Struttura ed Organizzazione degli Acidi Nucleici
I-B) Organizzazione della cromatina eucariotica
Prof. Vincenzo De Simone
Dott.ssa Luisa De Magistris
L’ “impalcatura” dei cromosomi eucariotici
Nucleosomi generati per digestione con DNasi
Lunghezza minima del DNA coperto dal nucleosoma
Il nucleosoma
Sequenza del DNA e posizionamento sul nucleosoma
Organizzazione dell’ottamero istonico
Struttura degli istoni del nucleosoma
Assemblaggio del nucleosoma
Istone H1 e compattamento della cromatina
Cromatina al microscopio elettronico
Due modelli per la fibra da 30 nm
Estremità aminoterminali e compattamento
Compattamento del DNA nel cromosoma
Ripiegamento del DNA nei cromosomi
Il filmato mostra un modello animato delle fasi successive di compattamento e ripiegamento del DNA fino alla formazione di un cromosoma.
Tipi di rimodellamento del nucleosoma
Approfondimento 1 : Modello Dinamico della Cromatina
Regioni libere da nucleosomi
Il minicromosoma di SV40
Approfondimento 2 : “Segnaposti” sui Geni
Ruolo degli istoni “varianti”
Approfondimento 3 : Varianti Istoniche
Approfondimento 4 : Cromatina Centromerica
Proteine adiuvanti del riassemblaggio dei nucleosomi (histone chaperons)
Acetilazione dei nucleosomi e replicazione
Modificazioni degli istoni
Proteine che legano gli istoni modificati
Il rimodellamento della cromatina
Approfondimento 5 : Metilazione e Replicazione
Approfondimento 6 : Modificazioni del core istonico
Approfondimento 7 : Cromatina e Memoria
Approfondimento 8 : Cromatina e Cellule Staminali
Approfondimento 9 : Domîni Cromatinici e Trascrizione
Le lezioni del Corso
Argomenti ed organizzazione del corso di Biologia Molecolare in formato e-learning
1. Composizione chimica e conformazioni degli acidi nucleici
2. Organizzazione della cromatina eucariotica
3. Metodiche di estrazione e di analisi degli acidi nucleici
4. Componenti e funzionamento della forca di replicazione
5. Controllo dell'inizio e della terminazione della replicazione
7. Ricombinazione e Riparo del DNA
8. Ricombinazione sito-specifica e trasposoni
9. Costruzione di molecole ricombinanti in vitro
10. Struttura e funzionamento dell'RNA polimerasi batterica
11. Regolazione della trascrizione nei procarioti
12. I saggi EMSA e DNAse I footprinting
13. Le tre RNA polimerasi eucariotiche ed i relativi promotori
14. Regolazione della trascrizione negli eucarioti
15. Studio dei promotori e delle unità trascrizionali eucariotiche
16. RNA catalitici e maturazione degli RNA eucariotici
17. Ribozimi ed RNA interference
18. Applicazioni pratiche dei ribozimi e dell'RNA interference
19. Le tappe della sintesi delle proteine in procarioti ed eucarioti
I materiali di supporto della lezione
Alberts B & al., Biologia Molecolare della Cellula (essenziale), Zanichelli, Cap. 8.
Brown TA, Genomi II, EdiSES, Cap. 2, 8.
Brown TA, Biotecnologia, EdiSES.
Lewin B, Il Gene (ed. compatta), Zanichelli, Cap. 28, 29.
Watson JD & al., Biologia Molecolare del Gene, Zanichelli, Cap. 7.
Il Podcast della lezione
Le altre lezioni del corso con podcast
Argomenti ed organizzazione del corso di Biologia Molecolare in formato e-learning
1. Composizione chimica e conformazioni degli acidi nucleici
2. Organizzazione della cromatina eucariotica
3. Metodiche di estrazione e di analisi degli acidi nucleici
4. Componenti e funzionamento della forca di replicazione
5. Controllo dell'inizio e della terminazione della replicazione
7. Ricombinazione e Riparo del DNA
8. Ricombinazione sito-specifica e trasposoni
9. Costruzione di molecole ricombinanti in vitro
10. Struttura e funzionamento dell'RNA polimerasi batterica
11. Regolazione della trascrizione nei procarioti
12. I saggi EMSA e DNAse I footprinting
13. Le tre RNA polimerasi eucariotiche ed i relativi promotori
14. Regolazione della trascrizione negli eucarioti
15. Studio dei promotori e delle unità trascrizionali eucariotiche
16. RNA catalitici e maturazione degli RNA eucariotici
17. Ribozimi ed RNA interference
18. Applicazioni pratiche dei ribozimi e dell'RNA interference
19. Le tappe della sintesi delle proteine in procarioti ed eucarioti
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