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Vincenzo De Simone » 2.Organizzazione della cromatina eucariotica


I – Struttura ed Organizzazione degli Acidi Nucleici

I-B) Organizzazione della cromatina eucariotica

Prof. Vincenzo De Simone

Dott.ssa Luisa De Magistris

L’ “impalcatura” dei cromosomi eucariotici


Nucleosomi generati per digestione con DNasi


Lunghezza minima del DNA coperto dal nucleosoma


Il nucleosoma


Sequenza del DNA e posizionamento sul nucleosoma


Organizzazione dell’ottamero istonico


Struttura degli istoni del nucleosoma


Assemblaggio del nucleosoma


Istone H1 e compattamento della cromatina


Cromatina al microscopio elettronico


Due modelli per la fibra da 30 nm


Estremità aminoterminali e compattamento


Compattamento del DNA nel cromosoma


Ripiegamento del DNA nei cromosomi

Il filmato mostra un modello animato delle fasi successive di compattamento e ripiegamento del DNA fino alla formazione di un cromosoma.


Tipi di rimodellamento del nucleosoma


Approfondimento 1 : Modello Dinamico della Cromatina


Regioni libere da nucleosomi


Il minicromosoma di SV40


Approfondimento 2 : “Segnaposti” sui Geni


Ruolo degli istoni “varianti”


Approfondimento 3 : Varianti Istoniche


Approfondimento 4 : Cromatina Centromerica


Proteine adiuvanti del riassemblaggio dei nucleosomi (histone chaperons)


Acetilazione dei nucleosomi e replicazione


Modificazioni degli istoni


Proteine che legano gli istoni modificati


Il rimodellamento della cromatina


Approfondimento 5 : Metilazione e Replicazione


Approfondimento 6 : Modificazioni del core istonico


Approfondimento 7 : Cromatina e Memoria


Approfondimento 8 : Cromatina e Cellule Staminali


Approfondimento 9 : Domîni Cromatinici e Trascrizione


I materiali di supporto della lezione

Alberts B & al., Biologia Molecolare della Cellula (essenziale), Zanichelli, Cap. 8.

Brown TA, Genomi II, EdiSES, Cap. 2, 8.

Brown TA, Biotecnologia, EdiSES.

Lewin B, Il Gene (ed. compatta), Zanichelli, Cap. 28, 29.

Watson JD & al., Biologia Molecolare del Gene, Zanichelli, Cap. 7.

Elaine Dunleavy, Alison Pidoux and Robin Allshire, "Centromeric chromatin makes its mark", Trends in Biochemical Sciences, Elsevier, 2005.

Wood et al. "Combinatorial chromatin modifications and memory storage: A code for memory?", Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2006.

Christian Lanctôt, Thierry Cheutin, et al., "Dynamic genome architecture in the nuclear space: regulation of gene expression in three dimensions", Nature Publishing Group, 2007.

Kevin D. Sarge, Ok-Kyong Park-Sarge, "Gene bookmarking: keeping the pages open", Trends in Biochemical Sciences, Elsevier, 2005.

Robert J. Klose, Adrian P. Bird, "Genomic DNA methylation: the mark and its mediators", Trends in Biochemical Sciences, Elsevier, 2006.

Jingji Jin, Yong Cai et all., "In and out: histone variant exchange in chromatin" Trends in Biochemical Sciences, Elsevier, 2005.

Philippe Collas, Agate Noer, Sanna Timoskainen, "Programming the genome in embryonic and somatic stem cells", Journal of Cellular and Molecular Medicine, Blackwell Publishing, 2007.

Erica L. Mersfelder, Mark R. Parthun, "The tale beyond the tail: histone core domain modifications and the regulation of chromatin structure", Nucleic Acids Research, 2006.

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