VI – Maturazione dell’mRNA e RNA catalitici
VI-B) Ribozimi ed RNA interference
Prof. Vincenzo De Simone
Dott.ssa Luisa De Magistris
Diverse tipologie di splicing alternativo
Splicing alternativo della Tropomiosina
Splicing alternativo della troponina
Splicing alternativo della β-amilasi
I trascritti early di SV40
Regolazione negativa dello splicing
Regolazione positiva dello splicing
Splicing alternativo in virus a DNA
Determinazione del sesso in D.melanogaster – I
Determinazione del sesso in D.melanogaster – II
Editing dell’mRNA per l’apolipoproteina B
Editing dei geni coxII di T.brucei
Meccanismo dell’editig mediante RNA guida – I
Meccanismo dell’editig mediante RNA guida – II
Meccanismo dell’editig mediante RNA guida – III
Trans-splicing in T. brucei
Gli RNA L-15 ed L-18
Regioni conservate degli introni di classe I
Centri catalitici nell’introne di classe I
Reazioni catalizzate da ribozimi
Reazioni catalizzate dall’RNA L-19
Attività enzimatiche del ribozima L-19
Ribozimi “hammerhead” di virusoidi
Sito catalitico di ribozimi “hammerhead”
“RNA interference”
RNA interference in filmato
Il filmato mostra una ricostruzione delle varie tappe del meccanismo di RNA interference.
Meccanismo d’azione dei miRNA – I
Meccanismo d’azione dei miRNA – II
Meccanismo d’azione dei miRNA – III
Multipli effetti del complesso RISC
Amplificazione dell’RNA interference
Approf. 1: Lo splicing alternativo
Approf. 2: La regolazione post-trascrizionale
Approf. 3: gli RNA che regolano la trascrizione
Approf. 4: I complessi RISC
Le lezioni del Corso
Argomenti ed organizzazione del corso di Biologia Molecolare in formato e-learning
1. Composizione chimica e conformazioni degli acidi nucleici
2. Organizzazione della cromatina eucariotica
3. Metodiche di estrazione e di analisi degli acidi nucleici
4. Componenti e funzionamento della forca di replicazione
5. Controllo dell'inizio e della terminazione della replicazione
7. Ricombinazione e Riparo del DNA
8. Ricombinazione sito-specifica e trasposoni
9. Costruzione di molecole ricombinanti in vitro
10. Struttura e funzionamento dell'RNA polimerasi batterica
11. Regolazione della trascrizione nei procarioti
12. I saggi EMSA e DNAse I footprinting
13. Le tre RNA polimerasi eucariotiche ed i relativi promotori
14. Regolazione della trascrizione negli eucarioti
15. Studio dei promotori e delle unità trascrizionali eucariotiche
16. RNA catalitici e maturazione degli RNA eucariotici
17. Ribozimi ed RNA interference
18. Applicazioni pratiche dei ribozimi e dell'RNA interference
19. Le tappe della sintesi delle proteine in procarioti ed eucarioti
I materiali di supporto della lezione
Alberts B & al. Biol. Mol. della Cellula (essenziale) Zanichelli
Brown TA Genomi II EdiSES Cap. 10
Brown TA Biotecnologie Molecolari EdiSES
Lewin B Il Gene VIII Zanichelli Cap. 9
Lewin B Il Gene (ed.compatta) Zanichelli Cap. 27
Watson JD & al. Biologia Molecolare del Gene Zanichelli Cap. 25
David R. Corey, Regulating mammalian transcription with RNA, Trends in Biochemical Sciences, 2005.
Il Podcast della lezione
Le altre lezioni del corso con podcast
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1. Composizione chimica e conformazioni degli acidi nucleici
2. Organizzazione della cromatina eucariotica
3. Metodiche di estrazione e di analisi degli acidi nucleici
4. Componenti e funzionamento della forca di replicazione
5. Controllo dell'inizio e della terminazione della replicazione
7. Ricombinazione e Riparo del DNA
8. Ricombinazione sito-specifica e trasposoni
9. Costruzione di molecole ricombinanti in vitro
10. Struttura e funzionamento dell'RNA polimerasi batterica
11. Regolazione della trascrizione nei procarioti
12. I saggi EMSA e DNAse I footprinting
13. Le tre RNA polimerasi eucariotiche ed i relativi promotori
14. Regolazione della trascrizione negli eucarioti
15. Studio dei promotori e delle unità trascrizionali eucariotiche
16. RNA catalitici e maturazione degli RNA eucariotici
17. Ribozimi ed RNA interference
18. Applicazioni pratiche dei ribozimi e dell'RNA interference
19. Le tappe della sintesi delle proteine in procarioti ed eucarioti
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